Muzejs darbu sāka kā Jēkabpils novadpētniecības un mākslas muzeja filiāle 1951. gadā un tā pirmsākuma ideja pieder Arnoldam Štokmanim (1985. – 1970.), vēstures skolotājam un senlietu krājējam. Muzejs bija izvietots nelielā paviljonā Kokneses parka teritorijā Daugavas krastā. Būvējot Pļaviņu HES, filiāle bija appludināmajā zonā un bija jālikvidē.